Пахучие железы — железы, выделяющие пахучий секрет, служащий для защиты, привлечения особей противоположного пола в брачный период, «ограждения» своей территории.
Среди беспозвоночных пахучие железы свойственны многочисленным членистоногим, особенно насекомым: клопам, жукам, гусеницам и т.д.
Пахучие железы развиты у позвоночных. У рыб они находятся, по-видимому, в коже, у крокодилов — под нижней челюстью и в области клоаки (мускусные железы). Пахучие железы располагаются на голове, туловище, конечностях, хвосте. Копытные животные помечают свою территорию потиранием шерсти о стволы деревьев.
У хорьков, куниц, скунса или вонючки пахучие железы служат средством химической защиты от преследователей.
В основании хвоста выхухоли расположены мускусные железы. Их сильно пахнущие выделения делают зверька несъедобным для хищника и служат ему надежным средством защиты.
Летучие пахучие вещества многих пахучих желез образуются в результате переработки микроорганизмами секрета этих желез в их резервуарах или выводных протоках.